初平三年（公元192年）四月，暮春的长安，空气中却弥漫着一股山雨欲来的压抑。董卓的暴政已至顶点，民怨沸腾，而一场酝酿于密室中的风暴，即将席卷这座古都。
经过王允的精心策划与煽动，吕布对董卓的恨意已达极致。双方约定，由吕布作为内应，伺机刺杀董卓。王允则联络了士孙瑞、黄琬等少数可信的同僚，并暗中取得了部分对董卓不满的宫廷宿卫的支持，准备在外策应。
这一日，机会终于来临。董卓因前夜宴饮，身体微恙，未上早朝，在郿坞休养。午后，吕布以“探望义父病情，并献上西域佳酿”为名，求见董卓。
董卓虽对吕布心生嫌隙，但自恃武勇，且郿坞守卫森严，吕布又是只身前来，便未多想，准其入内。吕布见到卧于榻上、略显疲惫的董卓，强压心头杀意，做出一副恭敬关切的模样，献上美酒。
“奉先我儿有心了。”董卓见吕布态度恭顺，心中稍慰，命人斟酒。他近日确实感到精力不济，又见吕布献酒，便多饮了几杯，加上药力发作，很快便觉昏昏沉沉，屏退左右，只留两名贴身侍女，沉沉睡去。
吕布侍立一旁，见董卓鼾声渐起，呼吸平稳，知道时机已到。他假意为董卓掖了掖被角，悄然靠近榻边，眼中凶光毕露。下一刻，他猛地抽出藏在袖中的短刀（或顺手拿起董卓置于榻边的佩剑），用尽全身力气，朝着董卓肥胖的脖颈狠狠刺下！
“老贼！受死！”吕布低吼一声。
董卓在睡梦中遭此巨变，只来得及闷哼一声，剧痛传来，双目圆睁，不可置信地看着面前面目狰狞的吕布，想要呼喊，却已被割断了喉咙，鲜血如同喷泉般涌出，瞬间染红了锦被和榻沿。他肥胖的身躯剧烈抽搐了几下，便彻底不动了。
那两名侍女吓得魂飞魄散，刚要尖叫，被吕布凶狠的目光一扫，顿时瘫软在地，瑟瑟发抖，不敢出声。
吕布确认董卓已死，提着滴血的凶器，大步走出寝室，对闻声赶来的董卓亲卫厉声喝道：“奉诏讨贼！董卓悖逆，已伏诛！敢有异动者，同罪！”
亲卫们见吕布手持利刃，浑身浴血，又闻董卓已死，顿时大乱。一部分人慑于吕布往日威名，不敢妄动；另一部分死忠则欲反抗，被吕布当场格杀数人，余者见势不妙，四散奔逃。
与此同时，王允等人按照约定，持伪造的诏书（或利用尚书台职权），迅速控制了宫门和部分要害部门，并宣布董卓罪状，称吕布奉密诏诛杀国贼。长安城中忠于汉室或早对董卓不满的官员、士兵纷纷响应，而西凉军群龙无首，李傕、郭汜、张济、樊稠等主要将领皆在外驻防或不在郿坞，城内一时陷入混乱，但反抗力量很快被王允、吕布联手镇压下去。
诛杀董卓，过程竟出乎意料的顺利。
王允迅速以司徒录尚书事的身份，总揽朝政。他做的第一件事，便是以皇帝（献帝）名义下诏，大赦天下，唯独不赦董卓一族及其核心党羽（如李儒等）。同时，宣布赦免原董卓集团中的大部分普通将领和官员，称他们是被董卓胁迫，只要悔过自新，便可既往不咎，试图以此稳定人心，分化瓦解西凉军集团。